Akbük Koyu, tarih boyunca çeşitli medeniyetlere ev sahipliği yapmış ve stratejik bir konumda yer almıştır. Bu bölge, antik dönemlerde deniz yollarının kesişim noktası olarak öne çıkarken, zamanla yerleşim merkezi haline gelmiştir. Hem doğal güzellikleri hem de tarihi kalıntıları ile ziyaretçilerine geçmişe yolculuk yapma fırsatı sunmaktadır.

Akbük Koyu, tarih boyunca önemli bir yerleşim merkezi olmuştur. Milas'ın antik çağlardaki adıyla Mylasa olarak bilinen dönemde bölge, deniz ticareti açısından önemli bir konumdaydı. Akbük Koyu ve çevresinde Bizans ve Osmanlı dönemlerinden kalma tarihi izler de bulunmaktadır. Bölgedeki en önemli antik kentlerden biri, Akbük'e oldukça yakın olan Herakleia'dır. Bu antik kent, antik dönemde Gökova Körfezi kıyısında kurulmuş bir ticaret ve liman şehriydi. Günümüzde de bu antik kentin kalıntılarına ulaşmak mümkündür. Akbük, 1991 yılında alınan bir kararla belediye statüsünü kazanmıştır.