Aphrodisias Antik Kenti'nin köklü tarihi, MÖ 5. yüzyıla kadar uzanmaktadır. Fakat bu yerleşim, daha önceleri Hellenistik dönemde küçük bir köy olarak varlık göstermiştir. Zamanla, stratejik konumu ve kültürel zenginlikleri sayesinde önemli bir merkez haline gelmiş, Roma İmparatorluğu döneminde ise zirveye ulaşmıştır. Ancak, monoteizmle birlikte yaşanan dönüşüm ve doğal afetler, kentin kaderini değiştirmiştir. Günümüzdeki keşifleriyle yeniden hayat bulan Aphrodisias, geçmişin izlerini ziyaretçilere sunmaktadır.

Aphrodisias Antik Kenti'nin tarihi, MÖ 5. yüzyılda başlamıştır. Kentin kuruluşu, Bizanslı yazar Stephanos'a göre MÖ 13. yüzyıla kadar dayandırılmaktadır. Aphrodisias, ilk olarak Hellenistik dönemde küçük bir yerleşimken kısa sürede bölgenin önemli merkezlerinden biri hâline gelmiştir. MÖ 2. yüzyılda kent devleti statüsü kazanmıştır. Roma İmparatorluğu ile yakın ilişkiler sayesinde, özellikle MÖ 1. yüzyıldan itibaren imparatorluk tarafından ayrıcalıklarla donatılmış ve Roma döneminde altın çağını yaşamıştır. Monoteizmin yayılmasıyla kentin önemi azalmış, tapınak 5. yüzyıl sonlarında kiliseye dönüştürülmüş ve Bizans döneminde şehir giderek küçülmüştür. Orta Çağ’da meydana gelen depremler ve değişen ticaret yolları nedeniyle kent terk edilmiş, kalıntıları toprak altında unutulmuş. Aphrodisias'ın modern keşfi, 20. yüzyıl ortalarında ünlü fotoğrafçı Ara Güler'in bölgeyi tesadüfen ziyaret etmesiyle gerçekleşmiştir. Bu keşif sonrası başlatılan kazılar sayesinde kent yeniden gün yüzüne çıkarılarak kültür mirasına kazandırılmıştır.